デフォルトの設定では、POPFile は過去2日間のメッセージしか保存しません。0.18.1 よりも古いバージョンの POPFile だと、履歴が多くなればなるほど動作が遅くなります。そのため、POPFile を効率良く動かすには、履歴を時々消すか 0.18.1 以降のバージョンにアップグレードするのが賢明です。

履歴をどのくらいの頻度で削除するのかは完全にユーザー次第です。ただし気をつけなければいけないのは、履歴を頻繁に削除していて、既に履歴上にないメッセージを後から再分類しようとしても、POPFile にはそのメッセージを参照する方法が全くないということです。

注釈: 履歴の削除はコーパス（分類に使用する単語集）のデータを変更することはなく、メールクライアントに保存されているメッセージにも全く影響を与えません。

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