YahooやHotmailのWebメールでPOPFileを使うことができますか？

POPFileは現在のところWebメールのシステムには対応していませんが、 YahooPOPs や HotPOP3 、 Hotmail Popper 、 MrPostman（YahooとHotmailの両方に対応）といった外部プログラムと連携して動くことができます。

詳しくは、ハウツーの プロキシとファイアウォールの設定 を参照してください。